После запуска нового платного канала средняя длительность сессии упала. При этом внутри органического канала и внутри платного длительность почти не изменилась. Какое объяснение наиболее логичное?

Общий показатель является смесью сегментных значений с весами, равными долям сегментов. Когда доли меняются, общий результат может измениться даже без изменений внутри сегментов. Поэтому важно мониторить состав аудитории и смотреть метрики на сопоставимом составе по сегменту. Объявлять это ошибкой инструментирования или отказываться от сегментации — значит терять контекст вместо того, чтобы его учитывать.